More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4171 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  100 
 
 		 122 aa  250  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  100 
 
 		 122 aa  250  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  79.31 
 
 		 123 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  68.1 
 
 		 119 aa  172  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  65.81 
 
 		 120 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  64.96 
 
 		 120 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  70 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  60.66 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  67.89 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  67.89 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  64.96 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  67.26 
 
 		 125 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  62.62 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  62.62 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  61.68 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  60.55 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  64.49 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  39.82 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  42.45 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  40 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  37.29 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  40 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.17 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.88 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  38.14 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.61 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  31.45 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.09 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  35.65 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  37.39 
 
 		 209 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  39.77 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  32.2 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.03 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  37.62 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  34 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>