More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01895 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  100 
 
 		 110 aa  226  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  63.89 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  57.28 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 172 aa  123  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  50.48 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  48.54 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  51.46 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  52.88 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  49.04 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  50 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  49.51 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  54.74 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  52.04 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  50.49 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  50.49 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  50 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  50 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  50.49 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 236 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 238 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 164 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  44.66 
 
 		 231 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 176 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 188 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  48.98 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  48.98 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 199 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 196 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  50.51 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  48.98 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 183 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 184 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  44.66 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>