More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0868 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  100 
 
 		 108 aa  217  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  63.89 
 
 		 110 aa  150  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  56.31 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  50 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  45.63 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 186 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  43.69 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  47.96 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  44.66 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 222 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  48.48 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 200 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 236 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 236 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 238 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 236 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  45.54 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  45.54 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  45.54 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 178 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  45.54 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  45.54 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.46 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  47.47 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 182 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 182 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 182 aa  97.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 182 aa  97.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 155 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 164 aa  96.7  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 156 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 156 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  44.9 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  43.43 
 
 		 183 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  44.9 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4229  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.0453464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  47.96 
 
 		 175 aa  94  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 176 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  43.43 
 
 		 161 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  43.43 
 
 		 161 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 181 aa  93.2  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 184 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 148 aa  93.2  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 188 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.35 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 186 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 176 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 187 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>