More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2281 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  100 
 
 
135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  100 
 
 
135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  100 
 
 
135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  60.43 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  39.74 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  42.45 
 
 
224 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  36.72 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  42.06 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.68 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  35.24 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  35.24 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  35.24 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  33.94 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  35.45 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.84 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.29 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  42.06 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.58 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  33.58 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.61 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.58 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  33.33 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  33.33 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  42.05 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  36.36 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  36.44 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.61 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  32.11 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  33.61 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  42.05 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  36.11 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  29.5 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  35.04 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  38.1 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  37.38 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  35.83 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  28.81 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  36.19 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1789  single-strand binding protein  43.24 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00011085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  30.53 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.26 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.45 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.04 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  34.86 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  36.13 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.04 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  32.5 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.61 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  32.12 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  30.84 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  28.24 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.83 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  37.38 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  32.12 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  34.91 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  33.93 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  38.1 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  29.86 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  35.4 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  37.17 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.04 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  34.86 
 
 
201 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  28.26 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.78 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  33.33 
 
 
192 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  35.78 
 
 
175 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  35.58 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.61 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  28.79 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  35.85 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  32.99 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  44.74 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  33.33 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  34.91 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  32.52 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.25 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  38.68 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  33.94 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  38.46 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  33.93 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.04 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.04 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.03 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  37.8 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  29.06 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>