More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0271 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.77 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  42.58 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  46.96 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.88 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  47.79 
 
 		 242 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.26 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  37.76 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  37.06 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  42.19 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.38 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 200 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  39.69 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  38.36 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 220 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 231 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  37.11 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  34.48 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  37.67 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  38.75 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 172 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 180 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  44.09 
 
 		 139 aa  97.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 183 aa  97.1  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 188 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 177 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.4 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  33.74 
 
 		 182 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  42.52 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  42.97 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  46 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.95 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 192 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 196 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 185 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  44.12 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 183 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 192 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 234 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 175 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 186 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 178 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>