More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0045 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  44.87 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  45.39 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  46.36 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  46.85 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  41.26 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  39.33 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  39.26 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  39.33 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  46.55 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  43.51 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  42.75 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  38 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  42.75 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  39.07 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  44.14 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  42.75 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  40.3 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 277 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  39.01 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  40.34 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  35.95 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  35.62 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  35.62 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  47.01 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  43.97 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  35.46 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  43.36 
 
 		 188 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43 
 
 		 161 aa  89.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  43.97 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  43.86 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  41.6 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  42.62 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  43.1 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  43.1 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 187 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  33.56 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 149 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 301 aa  87.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.67 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 173 aa  87  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  37.59 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.71 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 275 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 183 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 182 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 188 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 209 aa  84.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  43.14 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  38.66 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  42.16 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>