More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0651 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  34.94 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  45.13 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  46.96 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  46.09 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  33.71 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  45.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 222 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 242 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 183 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  45.6 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  43.86 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40.61 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  49.5 
 
 		 234 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.1 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  42.4 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  51.38 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  43.4 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  45.87 
 
 		 185 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.53 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  41.4 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.03 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.85 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  44.35 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  42.64 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.82 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  44.63 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 161 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 150 aa  97.1  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  45.69 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 136 aa  97.1  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 200 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  33.12 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  49.02 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  43.7 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  43.7 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  39.52 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  42.73 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  42.73 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>