More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0644 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  100 
 
 		 168 aa  341  4e-93  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.88 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.48 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  37.43 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 146 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  44.21 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  42.24 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  45.22 
 
 		 138 aa  89  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 133 aa  89  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  40.88 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.71 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 125 aa  87.8  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 125 aa  87.8  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  36.89 
 
 		 114 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  35.59 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  41.51 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  46.08 
 
 		 142 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 146 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  42 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 137 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  41.59 
 
 		 131 aa  84  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 186 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 187 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  38.71 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  29.89 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  39.17 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  36.7 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  35.34 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.06 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>