More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2655 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  100 
 
 		 150 aa  300  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  100 
 
 		 150 aa  300  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  56.05 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  45.88 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  45.88 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 172 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 172 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 173 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  44.51 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  44.51 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  43.9 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  43.79 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  42.21 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  47.29 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  41.56 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  39.61 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  39.61 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  51.4 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  37.95 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  38.73 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  47.47 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.16 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  47.62 
 
 		 166 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  39.26 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.15 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  37.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  37.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  37.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  37.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  43.84 
 
 		 188 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  49.51 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  39.74 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  33.77 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  38.82 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 159 aa  93.2  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  48 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  41.32 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  44.23 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  44.23 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  37.18 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  33.96 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  40.85 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  32.48 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  35.95 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  34.76 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.16 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  36.57 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.74 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 222 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.93 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  32.05 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  29.94 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  38.89 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>