More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2987 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  100 
 
 		 141 aa  291  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  71.92 
 
 		 146 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  47.26 
 
 		 142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  42.25 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  41.55 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  43.08 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 150 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 150 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  38.3 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  38.41 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  41.13 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  45.37 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  37.18 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.36 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  39.01 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  40.87 
 
 		 169 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.19 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.64 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  34.36 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.18 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.72 
 
 		 188 aa  94.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 172 aa  94.4  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 112 aa  94.4  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.78 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  35.46 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 111 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 185 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.62 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.24 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  39.52 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  37.9 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  38.66 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  37.1 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  35.33 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.36 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  39.44 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  41.18 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  30.94 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  41.18 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  41.18 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  33.86 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>