More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2228 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
111 aa  226  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  98.2 
 
 
112 aa  224  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  98.2 
 
 
112 aa  224  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  98.2 
 
 
112 aa  224  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  96.4 
 
 
112 aa  221  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  96.4 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  92.79 
 
 
112 aa  215  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  92.79 
 
 
111 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  91.89 
 
 
111 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  91.89 
 
 
111 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  83.33 
 
 
121 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
173 aa  150  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
173 aa  150  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
173 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
173 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 
170 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  59.09 
 
 
173 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  59.09 
 
 
164 aa  148  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  59.63 
 
 
172 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  59.63 
 
 
172 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  59.63 
 
 
169 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  58.72 
 
 
172 aa  146  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  56.36 
 
 
187 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  58.49 
 
 
164 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  56.6 
 
 
166 aa  140  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  57.52 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  57.55 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  57.55 
 
 
138 aa  137  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  54.13 
 
 
141 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  55.75 
 
 
172 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
169 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  55.66 
 
 
167 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 
188 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  55.66 
 
 
167 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  56.6 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  52.83 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  52.83 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  52.83 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  52.83 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  55.77 
 
 
119 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  55.34 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
185 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  51.89 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  51.89 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  49.55 
 
 
137 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  50.48 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  48.57 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  47.71 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  49.51 
 
 
150 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  51.4 
 
 
142 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  47.12 
 
 
140 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  48.18 
 
 
131 aa  103  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.57 
 
 
148 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  48.08 
 
 
136 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 
130 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  42.99 
 
 
142 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.67 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  45.05 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  43.4 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  43.27 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  45 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  43.64 
 
 
150 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  45 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  43.64 
 
 
150 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  44.86 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  44.55 
 
 
139 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  41.75 
 
 
136 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  39.62 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  39.62 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  42.59 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  39.64 
 
 
141 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  43.14 
 
 
134 aa  92  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  43.27 
 
 
133 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  37.5 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  38.39 
 
 
180 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  42.86 
 
 
161 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.35 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.38 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  37.5 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  38.68 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  37.04 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1703  single-stranded DNA-binding protein family  33.03 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  37.38 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.57 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40.19 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.35 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  41.35 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  39.09 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.19 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  34.26 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  34.26 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  39.25 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  34.86 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  39.64 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  33.65 
 
 
186 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  35.45 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  38.1 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  37.29 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>