More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  74.67 
 
 		 147 aa  228  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  66.23 
 
 		 151 aa  196  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  66 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  62.09 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  58.94 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  37.35 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  34.42 
 
 		 149 aa  95.1  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.89 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  32.77 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  33.52 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  34.29 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.15 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.71 
 
 		 188 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.35 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  37.23 
 
 		 209 aa  87.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  33.76 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  31.87 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 177 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  34.09 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  34.09 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.09 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  32.45 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  41.9 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  38.74 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.21 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.11 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30.12 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  45 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  40.35 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  31.29 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  40.35 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  31.41 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.47 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  33.56 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 224 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>