More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0023 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  71.52 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  69.62 
 
 		 150 aa  216  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  65.56 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  62.18 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  53.99 
 
 		 165 aa  170  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  55.92 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  43.21 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  38.41 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  37.42 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  43.48 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.36 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.31 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  41.94 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 184 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  40.34 
 
 		 176 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  38.79 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  42.2 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 185 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.48 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 209 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  39.68 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  34 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  38.81 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.79 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  36.72 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  35.42 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  35.42 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  35.42 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  32.89 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  37.19 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  35.42 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20180  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0170595  normal  0.0624754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  31.06 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  33.55 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  45 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  44 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 199 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 196 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 186 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 187 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  30.82 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  30.38 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  44 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.37 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>