More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02950 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  58.28 
 
 		 150 aa  190  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  58.9 
 
 		 147 aa  187  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  51.53 
 
 		 151 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  51.53 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  51.83 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  47.88 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  34.48 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.72 
 
 		 161 aa  97.4  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 149 aa  97.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  32.97 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 188 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.06 
 
 		 177 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  34.97 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.2 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 130 aa  94.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  40.85 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 151 aa  94.4  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  35.12 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  33.13 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  39.37 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  39.37 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  31.29 
 
 		 222 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  37.84 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  30.51 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  34.34 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.55 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 137 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  32.74 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  35.26 
 
 		 175 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 220 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  31.74 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  34.1 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  32.89 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  31.28 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 146 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  32.94 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 233 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  39.17 
 
 		 238 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  33.87 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  31.74 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  34.15 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 209 aa  85.1  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 199 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 185 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 184 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 196 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  32.2 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  32.2 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  32.2 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  32.2 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  32.2 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>