More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0830 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  100 
 
 		 141 aa  290  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  67.33 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  64.79 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  64.9 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  64.24 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  79.25 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  64.86 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  41.94 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  37.84 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  36.17 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.41 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20180  single-stranded DNA-binding protein  43.16 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0170595  normal  0.0624754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.86 
 
 		 188 aa  87  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 185 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 175 aa  87  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  37.21 
 
 		 167 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  31.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.19 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  42.06 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 209 aa  84.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 184 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  34.64 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  34.81 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.21 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  32.45 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  38.6 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  32.47 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  35.57 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.85 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.25 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  40 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  38.33 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  37.7 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  36.04 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  32.19 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>