More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  222  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20180  single-stranded DNA-binding protein  51.96 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0170595  normal  0.0624754 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  35.24 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.65 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 181 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  31.63 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  38.54 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  30 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  30 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  30 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  30 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  30 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  30 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  28.43 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  30 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  30 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  31.63 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  30 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  30 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  30 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  33.67 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  32.29 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  32.29 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  32.29 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>