More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0566 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  73.62 
 
 
163 aa  236  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 
172 aa  221  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  71.74 
 
 
138 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  65.06 
 
 
166 aa  211  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  64.79 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  56.1 
 
 
164 aa  181  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  54.71 
 
 
170 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  52.1 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 
173 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  50.9 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  54.44 
 
 
169 aa  176  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  53.18 
 
 
173 aa  175  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  53.49 
 
 
172 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  53.49 
 
 
172 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  52.91 
 
 
172 aa  173  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  49.47 
 
 
188 aa  167  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  57.66 
 
 
185 aa  164  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  49.7 
 
 
169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  62.02 
 
 
187 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  49.42 
 
 
172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  48.54 
 
 
167 aa  159  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  48.54 
 
 
167 aa  159  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  48.08 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  48.08 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  48.08 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  48.08 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  52.14 
 
 
137 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  52.38 
 
 
142 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  52.38 
 
 
142 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  60.95 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  55.05 
 
 
114 aa  137  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 
111 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  58.49 
 
 
111 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
111 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  57.55 
 
 
111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.95 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  56.6 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
112 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  42.21 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  41.67 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  48.12 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  42.75 
 
 
131 aa  123  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  42.25 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  50.47 
 
 
150 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  41.26 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  38.13 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  38.67 
 
 
148 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  41.55 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  42.03 
 
 
136 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  38.41 
 
 
129 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  43.06 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  41.13 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  38.46 
 
 
138 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  39.35 
 
 
150 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  39.35 
 
 
150 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  44.66 
 
 
114 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  44.66 
 
 
114 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  48.54 
 
 
146 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  41.01 
 
 
133 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 
129 aa  105  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  38.3 
 
 
141 aa  104  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  37.84 
 
 
151 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  36.17 
 
 
136 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  40 
 
 
140 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.04 
 
 
146 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  36.99 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  36.49 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  46.15 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.57 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  38.3 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.17 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  44.23 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43.81 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  35 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.26 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  36.88 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  35.25 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  37.5 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  37.5 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  37.98 
 
 
176 aa  94  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  36.75 
 
 
154 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  33.55 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.33 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  37.86 
 
 
147 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  33.11 
 
 
151 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1703  single-stranded DNA-binding protein family  38.39 
 
 
131 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  32.72 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  30.72 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.62 
 
 
172 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  30.72 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.42 
 
 
167 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>