More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0148 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  92.99 
 
 		 157 aa  308  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  92.99 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  87.97 
 
 		 158 aa  289  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  87.5 
 
 		 152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  86.08 
 
 		 156 aa  275  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  83.23 
 
 		 160 aa  273  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  40.32 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 161 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  40.94 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.06 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  41.23 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.03 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  34.53 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  33.82 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  33.82 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  40 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  36.3 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.45 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 301 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 242 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  40 
 
 		 275 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 277 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>