More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4110 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  56.7 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  56.7 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  71.05 
 
 		 175 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  72.73 
 
 		 166 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  58.16 
 
 		 151 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  57.64 
 
 		 152 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  61.61 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  60.34 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  41.45 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 166 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  42.27 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  55.65 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  41.15 
 
 		 171 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  56.14 
 
 		 158 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  52.29 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  57.52 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  55.75 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  50 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  49.17 
 
 		 135 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  49.17 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  49.12 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  46.56 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  42.05 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  51.38 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  43.03 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40.27 
 
 		 159 aa  121  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  51.75 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  42.22 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  38.62 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  49.61 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  51.79 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  39.49 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  55.66 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  47.93 
 
 		 152 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  41.56 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  47.41 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  48.28 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  52.43 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  41.98 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  51.46 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  48.76 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  51.46 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  50 
 
 		 155 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  37.31 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  51.92 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  50.94 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  37.63 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  44.93 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  37.63 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  44.2 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.33 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  52.73 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  49.54 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  52.43 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  52.73 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 148 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 130 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 182 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>