More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3020 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  37.57 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  47.86 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  37.43 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  42.36 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 300 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  45.6 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  45.3 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  38.55 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  44.92 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  45.3 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  41.52 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  42.94 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  42.94 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  47.01 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  42.94 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  43.59 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  39.53 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  35.26 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  42.74 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  40 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  36.93 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  45.3 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 166 aa  97.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  37.69 
 
 		 218 aa  95.5  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  38.62 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  36.23 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  40 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  33.33 
 
 		 193 aa  87.4  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  36.13 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.07 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  29.12 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  33.66 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2262  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  36.8 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  30.46 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  44.71 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  28.49 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  33.96 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  29.77 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>