More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2146 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  33.83 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  30.94 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  30.38 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  36.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  36.27 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  32.99 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  28.74 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  31.54 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  29.01 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.31 
 
 		 186 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  27.54 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  29.93 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  32.98 
 
 		 182 aa  57  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  27.66 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  29.08 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  27.66 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  29.27 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  28 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  34.31 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  27.61 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  23.81 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  29.13 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  28.35 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  31.37 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  26.77 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  26.77 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  31.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  26.92 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>