More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  68.72 
 
 		 188 aa  249  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  73.6 
 
 		 175 aa  239  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  71.28 
 
 		 182 aa  237  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  65.97 
 
 		 189 aa  229  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  71.26 
 
 		 165 aa  224  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  69.28 
 
 		 156 aa  223  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  67.63 
 
 		 173 aa  223  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  70.06 
 
 		 159 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  68.6 
 
 		 170 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  84.43 
 
 		 219 aa  216  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  69.28 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  65.92 
 
 		 177 aa  214  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  73.51 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  81.3 
 
 		 192 aa  212  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  66.86 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  62.3 
 
 		 189 aa  210  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 193 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  76.23 
 
 		 198 aa  208  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  64.53 
 
 		 300 aa  208  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  67.82 
 
 		 172 aa  206  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  67.82 
 
 		 172 aa  206  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  67.82 
 
 		 172 aa  206  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  61.82 
 
 		 153 aa  205  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  69.77 
 
 		 170 aa  203  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  64.29 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  60.69 
 
 		 166 aa  202  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  77.05 
 
 		 186 aa  201  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  58.5 
 
 		 193 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  68.24 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  64.91 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  75.21 
 
 		 178 aa  193  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  54.75 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  56.22 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  71.31 
 
 		 195 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  76.36 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  58.52 
 
 		 170 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  58.47 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  51.89 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  68.6 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  68.55 
 
 		 179 aa  173  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 218 aa  173  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  52.47 
 
 		 179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  48.82 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  63.41 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  47.54 
 
 		 225 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  47.93 
 
 		 179 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  48.03 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  42.62 
 
 		 305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.51 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38.16 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.46 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.34 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.34 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.65 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.31 
 
 		 137 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 		 173 aa  84  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.06 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  34.73 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  43 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  34.51 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  38.98 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  43 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  42 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  35.81 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  33.12 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  35.77 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.07 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  41 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  37 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  37 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>