More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4521 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  75.13 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  67.02 
 
 		 170 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  67.74 
 
 		 159 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  85.25 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  66.32 
 
 		 188 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  64.4 
 
 		 156 aa  215  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  69.31 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  62.37 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  68.42 
 
 		 175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  64.4 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  64.4 
 
 		 164 aa  210  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  84.87 
 
 		 173 aa  210  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  64.92 
 
 		 165 aa  209  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  81.15 
 
 		 182 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  63.98 
 
 		 167 aa  208  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  77.05 
 
 		 198 aa  207  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 168 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  78.05 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  83.19 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  83.19 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  83.19 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  78.69 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  77.24 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  56.68 
 
 		 153 aa  204  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  62.83 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  63.53 
 
 		 300 aa  201  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  78.69 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  77.05 
 
 		 166 aa  201  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  66.49 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  75.41 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  72.87 
 
 		 171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  63.78 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  81.82 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  75.63 
 
 		 163 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  62.77 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  73.55 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  60.42 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  62.77 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  72.73 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  63.91 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  59.59 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  63.71 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 167 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  56.41 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  64.17 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  46.72 
 
 		 305 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  45.67 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  46.61 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.07 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  36.22 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  36.22 
 
 		 173 aa  94.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.16 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.16 
 
 		 170 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.52 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  40.8 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  35.16 
 
 		 233 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.98 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.19 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  41 
 
 		 150 aa  80.9  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  33.55 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  35.94 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  41.05 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  36.45 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  37 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  38.35 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  39.6 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  31.79 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  43 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  32.85 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  36 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.88 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  38.02 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>