171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2025 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  48.28 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  47.54 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  37.42 
 
 		 230 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  44.35 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  44.35 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  44.35 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 240 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 191 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.94 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  41.94 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  36.45 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  32.03 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 218 aa  73.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  32.35 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.94 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  32.06 
 
 		 201 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 185 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  29.77 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.33 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  28.45 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  30.36 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  30.47 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.73 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  29.06 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  35 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  27.05 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  32.26 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  26.92 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  31 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  31.18 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  29.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  28.42 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>