66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1374 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.33 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  28.81 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  26.47 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  26.47 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  26.47 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  27.95 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  27.19 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  29.57 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  29.91 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  33.73 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  27.59 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  27.38 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  28.44 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 300 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  30.51 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  23.78 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  29.21 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  27.91 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  26.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  26.96 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  30.99 
 
 		 110 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  28.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  27.91 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  32.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  26.97 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  30.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  26.97 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  25.84 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  31.46 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  31.46 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 171 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  25.86 
 
 		 192 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  24.72 
 
 		 166 aa  42  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  35.59 
 
 		 166 aa  42  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  25.86 
 
 		 188 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  23.75 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  29.11 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  26.92 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  29.17 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  29.76 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>