144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  38.33 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  40.71 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  36.09 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  39.32 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36.64 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.35 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  40.83 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.82 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  44.78 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  34.68 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  40 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  34.5 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  33.11 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  28.45 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  35.16 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  34.45 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  33.05 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  33.05 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  33.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  31.36 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 300 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  29.37 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.73 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  33.88 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  33.88 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  33.88 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  30.72 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  31.78 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  30 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  29.32 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  41.79 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  31 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  32.18 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  31.11 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  27.74 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  34 
 
 		 301 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  30.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  30.84 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 148 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>