26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1907 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  43.48 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  49.3 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  47.14 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  45.07 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  38.81 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  40 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 240 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  43.28 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  41.79 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  32.91 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  33.85 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  33.82 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 168 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 167 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>