117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3616 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  60.71 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  69.53 
 
 		 162 aa  190  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  71.54 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  46.03 
 
 		 179 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  44.35 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  90.9  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  40.34 
 
 		 225 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 230 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40 
 
 		 118 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  39.6 
 
 		 305 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  41.22 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  38.13 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  40 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  35 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  35 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  31.95 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  41.38 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  41.38 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  36.48 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  35.34 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  35.43 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  34.45 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  33.79 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  32.79 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  35.65 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  32.34 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  34.68 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  34.18 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  26.47 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  26.27 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  27.27 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  27.66 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  33.88 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  26.6 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  23.31 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  27 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  27 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  28.65 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  32.2 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  29.11 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  27.83 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  28.28 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  26.76 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  29.29 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  23.44 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  26.6 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>