144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1351 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  47.5 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  39.31 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  41.43 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  39.46 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  39.26 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  47.78 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  32.47 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  39.13 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  35.39 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  38.81 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.91 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.56 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  41.3 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  40.62 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.22 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  34.68 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  31.2 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  38.52 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  29.49 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  50.79 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  32.1 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  31.9 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 300 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40.4 
 
 		 305 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  41.86 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  29.14 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  39.08 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  39 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.21 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  32.76 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  36.61 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  36.46 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  34.02 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  41.25 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  34.19 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  35.34 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  38.68 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  30.82 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  35.56 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  35.56 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  35.56 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  29.71 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  31.25 
 
 		 120 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1538  single-strand binding protein  23.29 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  33.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  31.73 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  25.16 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>