105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12502 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  336  8e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  61.4 
 
 		 168 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  61.4 
 
 		 168 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  61.4 
 
 		 168 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  63.69 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  66.9 
 
 		 162 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  47.54 
 
 		 151 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  38.71 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  39.74 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  84.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  38.69 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.18 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  34.85 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  35 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  33.08 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  32.89 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  33.05 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  32.2 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  33.99 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  36.73 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  30.52 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  27.5 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  32.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  29.29 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  31.36 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  28.81 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  29.08 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  32.2 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  30.7 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  29.13 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.37 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  29.05 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  29.9 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  32.8 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.51 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  28.26 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.26 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  29.49 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.26 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  38.27 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 211 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  27.55 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  31.96 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  31.07 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  26.92 
 
 		 152 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 143 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 181 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  25.6 
 
 		 148 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  31.63 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>