241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  37.5 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  34.97 
 
 		 190 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  36.09 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  34.81 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  42.39 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  32.64 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  35 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  41.3 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.59 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  30.63 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  35.14 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  32.23 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  31.51 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  29.7 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  30.58 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  28.8 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  32.43 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  35.09 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  31.5 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  29.06 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  28.67 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  29.45 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  32.46 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  35.42 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  30.92 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  30.36 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  30.17 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  30.37 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  30.84 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  45.16 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  28.45 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  28.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  31.68 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  31.68 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  30.36 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  30.19 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  29.7 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  30.1 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  30.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  29.7 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>