180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4668 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  100 
 
 		 118 aa  244  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  55 
 
 		 230 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 240 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  44.92 
 
 		 233 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 179 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 305 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  42.73 
 
 		 225 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 188 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 193 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  39.32 
 
 		 200 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.94 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  40 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 177 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 219 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 186 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 195 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 300 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  38.79 
 
 		 193 aa  84  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  36.75 
 
 		 191 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 198 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  38.18 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 218 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  35.34 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.84 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  40.22 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  37.82 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  36.15 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  31.09 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  40 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  32 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  32 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  33 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  32 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  31 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  31 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  30 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  29.9 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  31 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  30 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  25.47 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  30 
 
 		 230 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  31 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>