298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1811 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  44.83 
 
 		 118 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  37.86 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  30.9 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  30.71 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  27.17 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  32.17 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  31.09 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.38 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 300 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  29.75 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  37.63 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  31.09 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  30.32 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  28.57 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  31.93 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  31.09 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  32.19 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  32.19 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  32.19 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  34.21 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  32.97 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  25.2 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.6 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  27.33 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  30.06 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  29.07 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  33.62 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  28 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.58 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 119 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  34.26 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  31.29 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>