96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1126 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  100 
 
 		 174 aa  339  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  42.97 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  44.83 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 305 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.37 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  38.97 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  42.98 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  38.79 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  36.07 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  36.57 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  36.51 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  35.38 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  33.05 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  38.83 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  33.62 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  39.32 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  36.55 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.03 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  41.59 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  34.48 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  38.05 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  37.6 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  33.07 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  41.96 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  41.96 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  41.96 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  36.75 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  34.21 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  35.59 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.7 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  34.4 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  30.41 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2746  single-strand binding protein  27.46 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000389389  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  32.38 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  29.94 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  26.11 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  28 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 157 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  25.6 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>