138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2173 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  50.53 
 
 		 192 aa  179  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  42.25 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  37.24 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  42.48 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  38.98 
 
 		 211 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  39.83 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.78 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  32.14 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  39.32 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  35.39 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  33.59 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  32.87 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  39.53 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  30.7 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  29.49 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  30.7 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  29.82 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  32.99 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  31.31 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  31.31 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 130 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 130 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.69 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  31.31 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  31.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  27.83 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  28.45 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  28.08 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  25.22 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  34.02 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  26.72 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  26.53 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  27.56 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  32.93 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  28.66 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  25.79 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  28.07 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  31.03 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  28.21 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  29.9 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  33.67 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  30.16 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  26.72 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  30.17 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  25.66 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  25.66 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  25.66 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  28.85 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  33.73 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  38.27 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  28.33 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  33.65 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  34.92 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>