More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3699 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  100 
 
 
175 aa  342  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  67.19 
 
 
188 aa  243  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  73.03 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  74.59 
 
 
182 aa  235  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  71.59 
 
 
170 aa  231  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  70.31 
 
 
192 aa  227  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  71.75 
 
 
177 aa  227  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  68.91 
 
 
193 aa  227  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  71.02 
 
 
165 aa  226  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  70.53 
 
 
189 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  67.05 
 
 
156 aa  224  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  71.43 
 
 
159 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  69.1 
 
 
173 aa  220  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  67.22 
 
 
300 aa  218  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  66.48 
 
 
164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  65.26 
 
 
186 aa  217  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  71.59 
 
 
172 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  63.45 
 
 
193 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  71.59 
 
 
172 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  71.59 
 
 
172 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  70.99 
 
 
188 aa  215  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  81.97 
 
 
198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  82.79 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  66.85 
 
 
167 aa  210  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  64.4 
 
 
189 aa  210  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  69.32 
 
 
170 aa  210  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  81.15 
 
 
200 aa  209  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  67.43 
 
 
168 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  65.57 
 
 
169 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  62.78 
 
 
163 aa  203  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  69.54 
 
 
170 aa  203  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  64 
 
 
166 aa  203  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  58.62 
 
 
153 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  65.13 
 
 
195 aa  201  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  63.54 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  56.02 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  67.03 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  71.31 
 
 
191 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  77.27 
 
 
171 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  63.77 
 
 
218 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  64.89 
 
 
193 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  56.89 
 
 
179 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  50.58 
 
 
179 aa  164  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  46.07 
 
 
167 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  63.41 
 
 
201 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  54.03 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  52.46 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  48.36 
 
 
305 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  40.46 
 
 
148 aa  121  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  44.88 
 
 
179 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  45.3 
 
 
174 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  41.03 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.66 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.97 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  48.15 
 
 
230 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.97 
 
 
169 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.11 
 
 
173 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.11 
 
 
172 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.19 
 
 
118 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  43.51 
 
 
164 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.22 
 
 
240 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.23 
 
 
137 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  35 
 
 
233 aa  80.9  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  45 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.2 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  37.25 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  38.02 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  45.1 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  40 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  29.03 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.79 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.08 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  42.86 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.41 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  32.86 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  41.51 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  37.74 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  38.61 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  42.42 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  37.39 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  43.88 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.61 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>