More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2524 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  100 
 
 
188 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  74.21 
 
 
189 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  66.67 
 
 
166 aa  229  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  67.55 
 
 
182 aa  226  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  62.11 
 
 
165 aa  223  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  67.2 
 
 
175 aa  222  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  62.63 
 
 
156 aa  218  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  64.4 
 
 
170 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  62.83 
 
 
177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  64.25 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  64.95 
 
 
192 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  63.73 
 
 
173 aa  210  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  60.73 
 
 
164 aa  208  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  63.49 
 
 
186 aa  207  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  63.78 
 
 
193 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  61.78 
 
 
172 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  77.87 
 
 
159 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  61.78 
 
 
172 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  61.78 
 
 
172 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  58.46 
 
 
167 aa  204  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  77.05 
 
 
219 aa  204  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  61.58 
 
 
168 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  77.05 
 
 
189 aa  202  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  72.95 
 
 
198 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  64.36 
 
 
178 aa  201  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  73.68 
 
 
300 aa  201  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  55.08 
 
 
153 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  75.4 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  61.78 
 
 
170 aa  197  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  72.95 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  57.36 
 
 
169 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  53.09 
 
 
163 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  56.68 
 
 
170 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  79.09 
 
 
171 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  59.49 
 
 
195 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  62.84 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  65.93 
 
 
171 aa  185  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  54.1 
 
 
193 aa  184  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  69.42 
 
 
191 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  58.12 
 
 
182 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  66.94 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  51.1 
 
 
179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  42.63 
 
 
167 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  61.79 
 
 
201 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  50.38 
 
 
148 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  49.59 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  45.59 
 
 
179 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 
305 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  48.82 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  40.17 
 
 
174 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.16 
 
 
169 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.16 
 
 
170 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.48 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.48 
 
 
173 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  36.81 
 
 
164 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.81 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  43.9 
 
 
164 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.68 
 
 
172 aa  87  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  41 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  35.77 
 
 
233 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 
154 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  39.5 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  36.75 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  42 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  39.25 
 
 
118 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  39.5 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  38.58 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  31.52 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  42.57 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  33.52 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  39.1 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  37.82 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  36.48 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  40.2 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.61 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  40.2 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.76 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  40 
 
 
114 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.06 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.71 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  35.77 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  34.4 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  42 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38 
 
 
150 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  41 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  39.8 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  40 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  35.38 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  43.4 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>