107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 211 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 177 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  40.34 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  40.46 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  35.45 
 
 		 161 aa  85.9  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  40.71 
 
 		 178 aa  84.7  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  37.24 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  37.17 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  34.12 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  36.97 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  30.98 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  35 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  39.47 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.76 
 
 		 151 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  35 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  37.11 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  35 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  30 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  29.73 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  30.91 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  28.18 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  27.59 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.19 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  33.86 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  33.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  31.33 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.52 
 
 		 162 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  30.11 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  27.06 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  24.51 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  22.81 
 
 		 175 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  29.03 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  27.96 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  22.7 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  27.96 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  27.96 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  34.15 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  27.96 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  32.52 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>