More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  100 
 
 		 156 aa  313  8e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  80.61 
 
 		 165 aa  257  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  76.47 
 
 		 170 aa  254  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  79.27 
 
 		 164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  79.76 
 
 		 168 aa  243  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  77.01 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  74.42 
 
 		 172 aa  240  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  74.42 
 
 		 172 aa  240  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  74.42 
 
 		 172 aa  240  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  77.06 
 
 		 170 aa  240  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  76.51 
 
 		 159 aa  236  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  67.23 
 
 		 177 aa  233  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  64.21 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  71.86 
 
 		 167 aa  224  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  71.78 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  65.59 
 
 		 182 aa  220  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  68.42 
 
 		 166 aa  219  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  67.25 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  71.97 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  69.28 
 
 		 166 aa  218  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  60.32 
 
 		 189 aa  218  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  64.92 
 
 		 186 aa  216  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  67.05 
 
 		 175 aa  215  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  85.25 
 
 		 219 aa  215  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  71.01 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  61.62 
 
 		 193 aa  213  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  62.64 
 
 		 300 aa  209  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 192 aa  207  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  63.79 
 
 		 170 aa  206  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  61.17 
 
 		 188 aa  205  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  58.08 
 
 		 198 aa  204  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  60.99 
 
 		 178 aa  203  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  76.23 
 
 		 189 aa  200  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  76.23 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  59.49 
 
 		 195 aa  196  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  63.74 
 
 		 182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  76.86 
 
 		 191 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  80 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  48.7 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  61.9 
 
 		 218 aa  174  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  69.35 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  51.5 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 179 aa  164  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  52.41 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  64.71 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  48.51 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  48.36 
 
 		 305 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  49.17 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  37.8 
 
 		 233 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 230 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38.36 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38.36 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.65 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.17 
 
 		 118 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 240 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 173 aa  87.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.82 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  38.46 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 172 aa  84.3  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  42 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.26 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.05 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  34 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  38.33 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  44.21 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  32.92 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  41.84 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  34.67 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  38.16 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.05 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  36.55 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  36.76 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  41 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>