More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0128 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  75.45 
 
 
167 aa  235  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  73.37 
 
 
169 aa  222  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  73.17 
 
 
156 aa  221  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  68.05 
 
 
165 aa  217  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  70.93 
 
 
168 aa  215  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  69.23 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  66.29 
 
 
170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  62.96 
 
 
153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  74.17 
 
 
188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  64 
 
 
173 aa  208  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  65.48 
 
 
164 aa  206  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  60.92 
 
 
171 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  63.07 
 
 
172 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  63.07 
 
 
172 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  63.07 
 
 
172 aa  201  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  66.09 
 
 
170 aa  201  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  78.69 
 
 
219 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  55.38 
 
 
188 aa  200  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  59.49 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  64.29 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  61.33 
 
 
177 aa  197  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  61.14 
 
 
166 aa  197  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  60.11 
 
 
170 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  61.11 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  74.38 
 
 
191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  74.59 
 
 
193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  74.59 
 
 
186 aa  192  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  55.44 
 
 
189 aa  192  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  73.77 
 
 
182 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  71.31 
 
 
198 aa  191  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  54.17 
 
 
192 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  56.47 
 
 
300 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  55.67 
 
 
193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  69.67 
 
 
200 aa  184  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  57.84 
 
 
182 aa  181  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  48.19 
 
 
193 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  65.57 
 
 
189 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  60.15 
 
 
218 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  69.17 
 
 
178 aa  175  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  69.09 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  50.58 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  52.86 
 
 
179 aa  157  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  59.68 
 
 
179 aa  153  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  47.48 
 
 
225 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  48.08 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  58.82 
 
 
201 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  47.54 
 
 
305 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  44.19 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  41.73 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  41.03 
 
 
174 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.09 
 
 
191 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  36.94 
 
 
137 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  40.83 
 
 
185 aa  90.9  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  37.93 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.34 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  44.26 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.46 
 
 
118 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  37.19 
 
 
183 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  35.83 
 
 
233 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  43.52 
 
 
230 aa  84.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  43.52 
 
 
240 aa  84.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.67 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  42 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  35.06 
 
 
185 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  42.99 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  34.58 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.12 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  40.57 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  45 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  40.57 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.12 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  38.14 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  42 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  35.04 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  43.88 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  35.04 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  35.04 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.2 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  45.26 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  39.6 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>