104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2643 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  39.69 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  37.7 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  38.66 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  32.39 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  33.99 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  33.99 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  33.99 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.75 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.39 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  34.92 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.11 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  39.56 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  32.81 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  32.82 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  38.64 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  30.92 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  28.9 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  30.41 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.56 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  32 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  27.19 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  30.71 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  34.26 
 
 		 305 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  30.41 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  30.83 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  30.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  28.12 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  29.56 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  29.48 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  31.97 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  28.93 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  30.33 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  29.31 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  29.32 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 120 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  30.25 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  30.25 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  30.25 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  28.69 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  30.33 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  27.87 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  31.15 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  28.71 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  29.17 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30.38 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  27.7 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  26.85 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  28.69 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0588  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.84642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  27.87 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2262  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  30.19 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  28.44 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1650  single-strand binding protein  30 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  28.92 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  28.69 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6546  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  28.26 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  26.23 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  27.83 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  32 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  31.76 
 
 		 120 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  29.87 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  29.87 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>