More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1650 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1650  single-strand binding protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  46.6 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  47.57 
 
 		 182 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 183 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 186 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 184 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 184 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  46.6 
 
 		 181 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 185 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  45.1 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  46.6 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  47.57 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  47.57 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  38.41 
 
 		 188 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  40.62 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.85 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  39.37 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  39.5 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.53 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  33.87 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.77 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  38.79 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 171 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  40.2 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  32.85 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 234 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  37.41 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  42.31 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  36.03 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  33.56 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 180 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  38.74 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>