126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2262 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2262  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 129 aa  266  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.8 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4795  hypothetical protein  79.55 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.603947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  32 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.15 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  34.96 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  33.87 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  35.35 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  33.88 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  37.37 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  32.32 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  32.32 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  29.17 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  34.34 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  34.34 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06800  single-stranded DNA-binding protein  26.83 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  29.41 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  24.03 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1958  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00338031  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  31.71 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  27.56 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  28.28 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  28 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  24.21 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  29.69 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  30.08 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  22.9 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  24.21 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  25.25 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  32.93 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  30.89 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  30.71 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  29.29 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  25.69 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  27.37 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  27.37 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  26.02 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  27.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  27.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  30.89 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  32.14 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  27.37 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  27.37 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  25.51 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  26.61 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  27.37 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  28.24 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  32.04 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  29.6 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>