More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1958 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1958  single-strand binding protein  100 
 
 		 230 aa  456  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00338031  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0457  single-strand binding protein  82.33 
 
 		 230 aa  346  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  35.79 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  35.79 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  32 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  34.74 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  35.79 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  34.74 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  34.74 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  35.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  35.63 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  32.14 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  27.18 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  33.68 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  32.63 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  29.47 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  30 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 153 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  25.38 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  29 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.23 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  27.83 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  27.83 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  32.63 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  29.2 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 146 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  26.73 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  35.63 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 148 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  27.48 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 146 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 150 aa  52.8  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 176 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  30.47 
 
 		 147 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 179 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  28.42 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  32.18 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  29.2 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  26.98 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  29.47 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  32.04 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  27.93 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  27.93 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  38.16 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  27.93 
 
 		 148 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>