20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06800  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 147 aa  299  8.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00120  Single-strand binding protein family  62.16 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0570  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  44.97 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2347  hypothetical protein  41.53 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1572  hypothetical protein  41.53 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.304855  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0798  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2262  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  26.83 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  30.84 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  28.75 
 
 		 161 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  34.04 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  30.48 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  30.48 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  26.04 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  30.48 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 191 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1958  single-strand binding protein  30.14 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00338031  normal  0.0286488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>