More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2923 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  100 
 
 		 120 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  28.93 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  31.34 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  32.08 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  29.25 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  34.69 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  29.25 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  33.67 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 196 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 171 aa  66.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 180 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  31.73 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  34.69 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  35.48 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  30.19 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  29.52 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  31.13 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  34.69 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  35.87 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  31.75 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  33.91 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  32.67 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  32.23 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  38.37 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  32.79 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  34.02 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34.02 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  29.25 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>