More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4669 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  100 
 
 		 159 aa  331  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  80.45 
 
 		 133 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  67.16 
 
 		 135 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  65.93 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  62.96 
 
 		 136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  62.77 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  56 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  56.2 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  54.14 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  50.89 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.76 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.24 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.8 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40.98 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.64 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  37.9 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 170 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  43.24 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  43.24 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 176 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  39.06 
 
 		 190 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  38.6 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 185 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  40 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  34 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 196 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  39.06 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38.94 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  38.39 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  41.12 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  41.12 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  31.76 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>