More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3178 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  100 
 
 		 133 aa  278  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  80.45 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3361  single-strand binding protein  75.56 
 
 		 136 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437989  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  73.88 
 
 		 135 aa  213  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  73.33 
 
 		 136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  65.69 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  55.04 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  53.49 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  52.63 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3966  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  53.57 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.64 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  32.9 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.9 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  36.88 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  36.88 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 191 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  35.33 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  40 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.89 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.52 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  36.64 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.74 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  38.74 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  32.89 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  33.75 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  31.01 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  34 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.7 
 
 		 190 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 180 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.06 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  37.19 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  39.09 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  36.59 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  34.35 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  33.85 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  29.53 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>