More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1033 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  63.35 
 
 		 164 aa  214  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  56.02 
 
 		 172 aa  198  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  54.45 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  75.21 
 
 		 148 aa  190  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02018  single-stranded DNA binding protein  68.12 
 
 		 147 aa  158  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  58.99 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  55.48 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  65.25 
 
 		 165 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  65.25 
 
 		 165 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  55.48 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  46 
 
 		 168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  55.48 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  55.48 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  66.06 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  55.88 
 
 		 158 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  64.1 
 
 		 163 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  55.48 
 
 		 236 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  51.2 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  63.64 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  56.91 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50.34 
 
 		 159 aa  148  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  51.11 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  43.09 
 
 		 152 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  55.15 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50.34 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  46.81 
 
 		 157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  56.06 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  62.28 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  46.39 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  59.46 
 
 		 160 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  59.02 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  54.41 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  47.45 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  41.95 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  53.04 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  44.29 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  49.29 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  57.02 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  60 
 
 		 234 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  45.88 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  41.15 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  60.36 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  57.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48.5 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  46.71 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  44.9 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  42.27 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  46.43 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  42.56 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.11 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  40.96 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  60.38 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  56.14 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  57.66 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  62.26 
 
 		 181 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  46.04 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4247  single-strand binding protein  53.97 
 
 		 246 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.301307  hitchhiker  0.0000000000394233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  41.55 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  59.43 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  61.32 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  59.43 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  45.32 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  60.38 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  60.38 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  60.38 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>