More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02018 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02018  single-stranded DNA binding protein  100 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  65.56 
 
 		 164 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  68.75 
 
 		 191 aa  159  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  64.9 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  66.32 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  44.22 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  44.22 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  47.02 
 
 		 178 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  61.63 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  44.9 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  44.87 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  49.67 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40.14 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  44.08 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  58.82 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  62.96 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  47.44 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  45.95 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  52.63 
 
 		 231 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  45.03 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  55.88 
 
 		 175 aa  103  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.59 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 		 165 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  43.95 
 
 		 177 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.06 
 
 		 222 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 190 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  43.79 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  50.33 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  56.82 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  61.54 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  45 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  42.38 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  60.49 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  61.54 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  60.49 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  60.49 
 
 		 214 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  55.13 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  41.89 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.19 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  55.84 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  46.36 
 
 		 180 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  45.8 
 
 		 200 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  60.49 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  41.22 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  60.49 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  40.4 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  52.43 
 
 		 188 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.51 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  45.39 
 
 		 180 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  48.68 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  48.68 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  48.68 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  48.68 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  48.68 
 
 		 176 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  57.5 
 
 		 234 aa  95.9  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  44.08 
 
 		 162 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 196 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 178 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.14 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 186 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 184 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 187 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  39.33 
 
 		 201 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  58.54 
 
 		 188 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  47.73 
 
 		 222 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.18 
 
 		 165 aa  93.6  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 182 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  58.97 
 
 		 181 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 186 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  57.69 
 
 		 184 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>